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发布时间:2022-01-09 03:42:28
转录组重测序
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。转录组研究是***功能及***结构等研究的基础,通过新一代高通量测序,能够快速的获得某一物种特定***或在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于临床诊断、基础研究和研发等领域。(一)***标准:***标准采用三步法,即:乳糖发酵试验、分离培养和证实试验。
转录组Resequencing针对的是有参考***组的物种。用新一代高通量测序技术对某物种的特定***或细胞进行转录组测序,与参考***组比较,可以得到***表达差异、可变剪接、融合***等遗传调控信息。
凝胶阻滞迁移电泳检测服务(EMSA)
EMSA实验
EMSA:凝胶迁移或电泳迁移率检测是一种检测蛋白质和DNA序列相结合的技术,初用于研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用,可用于定性和定量分析。分为2种类型:同位素标记探针,非同位素标记探针。
通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,在非变性的聚bing烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。DNA-复合物或RNA-复合物比非结合的探针移动得慢。同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,可是双链或者是单链。当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽提液。在检测RNA结合蛋白时,依据目的RNA结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的DNA或RN片duan和gua核苷酸片段(特异),和其它非相关的片段(非特异),来确定DNA或RNA结合蛋白的特异性。由于ChIP采用甲醛固定活l细胞或者***的方法,因此能比较真实的反映细胞内TF与Promoter的结合情况,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与***表达的关系。在竞争的特异和非特异片段的存在下,依据复合物的特点和强度来确定特异结合。
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